Scholar Tasks

1. ARTVİN ÇORUH ÜNİVERSİTESİ, SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU, TIBBİ HİZMETLER VE TEKNİKLER BÖLÜMÜ, TIBBİ LABORATUVAR TEKNİKLERİ PR., DOÇENT, 2023 -
2. ARTVİN ÇORUH ÜNİVERSİTESİ, SAĞLIK HİZMETLERİ MESLEK YÜKSEKOKULU, TIBBİ HİZMETLER VE TEKNİKLER BÖLÜMÜ, TIBBİ LABORATUVAR TEKNİKLERİ PR., DOKTOR ÖĞRETİM ÜYESİ, 2020 - 2025
3. University of Oklahoma, Fen-edebiyat, Kimya-Biyokimya, DOKTOR ÖĞRETİM ÜYESİ, 2021 - 2022
4. GÜMÜŞHANE ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK VE DOĞA BİLİMLERİ FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ, ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ, 2018 - 2020
5. YILDIZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, KİMYA-METALURJİ FAKÜLTESİ, BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ, BİYOMÜHENDİSLİK ANABİLİM DALI, ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ, 2011 - 2018
6. GÜMÜŞHANE ÜNİVERSİTESİ, MÜHENDİSLİK VE DOĞA BİLİMLERİ FAKÜLTESİ, GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ, ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ, 2010 - 2011

Papers

1. Molecular Description of Some Medicinal Aromatic Lamiaceae species from Artvin, Türkiye

   Yazarlar : AKYILDIRIM BEĞEN HAYAL,EMİNAĞAOĞLU ÖZGÜR,ŞEKER PERİNÇEK SEÇKİNOZAN,SELÇUK AHMET YESARİ,YAKIN BATUHAN YAMAN,TEKİNER AYDIN NASİBE,SARIYER EMRAH,SARAL SARIYER AYŞEGÜL, Yayın Yeri : The 7th International Symposium on EuroAsian Biodiversity (SEAB),, ERZURUM, TÜRKİYE, 2024 Basım Tarihi : 06.10.2024 Etkinlik Tarihi : 22.08.2024 -
   Uluslararası Özet bildiri

2. Increased Sensitivity to the Aromatic Antibiotic Novobiocin in Acinetobacter Baumannii By Vanillic Acid-Mediated Upregulation Of pcaH and pcaG genes

   Yazarlar : SARAL SARIYER AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH,Zgurskaya Helen I, Yayın Yeri : XXVIII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry, ROMA, İTALYA, 2024 Basım Tarihi : 05.09.2024 Etkinlik Tarihi : 01.09.2024 - 05.09.2024
   Uluslararası Özet bildiri

3. The Ability of Resveratrol to Potentiate Novobiocin in Adeijk Efflux Pump Overexpressing Acinetobacter Baumannii

   Yazarlar : SARIYER EMRAH,SARAL SARIYER AYŞEGÜL,Zgurskaya Helen I, Yayın Yeri : XXVIII EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry, ROMA, İTALYA, 2024 Basım Tarihi : 05.09.2024 Etkinlik Tarihi : 01.09.2024 - 05.09.2024
   Uluslararası Özet bildiri

4. Genetic Identification of some Medicinal- Aromatic Plants from Artvin, Türkiye.

   Yazarlar : AKYILDIRIM BEĞEN HAYAL,EMİNAĞAOĞLU ÖZGÜR,ŞEKER PERİNÇEK SEÇKİNOZAN,SELÇUK AHMET YESARİ,YAKIN BATUHAN YAMAN,TEKİNER AYDIN NASİBE,SARAL SARIYER AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : BSU Phytopathology and Biodiversity, GÜRCİSTAN, 2024 Etkinlik Tarihi : 19.11.2024 - 21.11.2024
   Uluslararası Özet bildiri

5. Mutations in the RND transporter AdeJ of Acinetobacter baumannii reducing the activity of AdeIJK efflux pump

   Yazarlar : SARAL SARIYER AYŞEGÜL, SARIYER EMRAH, Leus Inga, Zgurskaya Helen, Yayın Yeri : Biophysics Thematic Meetings (Physical and Quantitative Approaches to Overcome Antibiotic Resistance, İSVEÇ, 2022 Basım Tarihi : 18.08.2022 Etkinlik Tarihi : 14.08.2022 - 18.08.2022
   Uluslararası Özet bildiri

6. Chromosomal deletion of adeL gene in Acinetobacter baumannii ATCC 17978 leads to overexpression of AdeAB efflux pump

   Yazarlar : SARIYER EMRAH, SARAL SARIYER AYŞEGÜL, Leus Inga, Zgurskaya Helen, Yayın Yeri : Biophysics Thematic Meetings (Physical and Quantitative Approaches to Overcome Antibiotic Resistance, İSVEÇ, 2022 Basım Tarihi : 18.08.2022 Etkinlik Tarihi : 14.08.2022 - 18.08.2022
   Uluslararası Özet bildiri

7. Investigation of Bacteroides fragilis Enolase Inhibitors by in silico Methods

   Yazarlar : Ugurel erennur,KOÇER SİNEM,SARIYER EMRAH,MUTLU ÖZAL,UĞUREL OSMAN MUTLUHAN,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Eurasian Congress of Molecular Biotechnology (ECOMB 2019), 2019 Basım Tarihi : 21.09.2019 Etkinlik Tarihi : 19.09.2019 - 21.09.2019
   Uluslararası Özet bildiri

8. Cloning and Sequence Analysis Of Enolase Gene From Fusobacterium Nucleatum

   Yazarlar : Yakarsönmez Sinem, Çayır Ebru, SARIYER EMRAH, MILWARD MIKE, COOPER PAUL, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : II. International Congress on Molecular Biology, 2013 Basım Tarihi : 23.11.2013 Etkinlik Tarihi : 22.11.2013 - 23.11.2013
   Uluslararası Özet bildiri

9. Binding Site Identification and Molecular Docking Studies of Fusobacterium nucleatum Lactate Dehydrogenase

   Yazarlar : SARIYER EMRAH, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 2 Nd Internatıonal Bau-Drug Desıgn Symposıum, 2014 Basım Tarihi : 19.04.2014 Etkinlik Tarihi : 17.04.2014 - 19.04.2014
   Uluslararası Özet bildiri

10. Kinetic Evaluation of Enolase Enzyme From Fusobacterıum nucleatum Towards New Drug Design Studies

    Yazarlar : Yakarsönmez Sinem, Çayır Ebru, SARIYER EMRAH, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 2 Nd Internatıonal Bau-Drug Desıgn Symposıum, 2014 Basım Tarihi : 19.04.2014 Etkinlik Tarihi : 17.04.2014 - 19.04.2014
    Uluslararası Özet bildiri

11. Yeni β-laktamaz İnhibitörlerinin Keşfine Yönelik Kuersetinin CTX-M-15’e Bağlanma Afinitesinin in siliko Yöntemle Araştırılması

    Yazarlar : SARAL AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH,ÖZAD DÜZGÜN AZER, Yayın Yeri : 31. Ulusal Kimya Kongresi, TÜRKİYE, 2019 Basım Tarihi : 13.09.2019 Etkinlik Tarihi : 10.09.2019 - 13.09.2019
    Ulusal Özet bildiri

12. Moleküler Dinamik Simülasyonları İle CTX-M-15 İle Kuersetin Arasındaki Etkileşimin Analizi

    Yazarlar : SARAL AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : 31. Ulusal Biyokimya Kongresi, TÜRKİYE, 2020 Basım Tarihi : 24.12.2020 Etkinlik Tarihi : 18.12.2020 - 20.12.2020
    Ulusal Özet bildiri

13. Fusobacterıum nucleatum’un Enolaz Enziminin Yüksek Saflıkta Üretilmesi

    Yazarlar : Yakarsönmez Sinem, Çayır Ebru, SARIYER EMRAH, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 22. Ulusal Biyoloji Kongresi, 2014 Basım Tarihi : 27.06.2014 Etkinlik Tarihi : 23.06.2014 - 27.06.2014
    Ulusal Özet bildiri

14. Optimum pH Determination and Thermostability Analysis of Recombinant Fusobacterium nucleatum Enolase Enzyme

    Yazarlar : Yakarsönmez Sinem, Nural Belma, SARIYER EMRAH, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MOLECULAR CHEMISTRY, 2014 Basım Tarihi : 19.12.2014 Etkinlik Tarihi : 18.12.2014 - 19.12.2014
    Uluslararası Özet bildiri

15. Molecular Modelling of Enolase From Trypanosoma cruzi that Causes Chagas’ Disease

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MOLECULAR CHEMISTRY, 2014 Basım Tarihi : 19.12.2014 Etkinlik Tarihi : 18.12.2014 - 19.12.2014
    Uluslararası Özet bildiri

16. Analysis of Bos Taurus Enolase- Substrate Interactions By Homology Modelling, Molecular Docking and Molecular Dynamic Simulation

    Yazarlar : SARIYER EMRAH,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : UGM Conference 2017, 2017 Basım Tarihi : 20.05.2017 Etkinlik Tarihi : 16.05.2017 - 19.05.2017
    Uluslararası Özet bildiri

17. Investigation of DNA Words Showing SNP Similarity By Using Natural Language Processing Methods For Human Genome

    Yazarlar : Kulaksız Gülden, YILMAZ ALPER, SARIYER EMRAH, Noyan Oğuzhan, ÖZAD DÜZGÜN AZER, Yayın Yeri : Eurasian Congress on Molecular Biotechnology (ECOMB2019), 2019 Basım Tarihi : 21.09.2019 Etkinlik Tarihi : 19.09.2019 - 21.09.2019
    Uluslararası Özet bildiri

18. Influx of Carbapenems via outer membrane protein CarO in Acinetobacter baumannii

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : 10.International Moleculer Biology and Biotechnology Congress, 2021 Basım Tarihi : 12.10.2021 Etkinlik Tarihi : 04.10.2021 - 08.10.2021
    Uluslararası Özet bildiri

19. Acinetobacter baumannii’de CarO dış zar proteinin imipenem spesifikliği

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : 33. Ulusal Kimya Kongresi, TÜRKİYE, 2021 Basım Tarihi : 12.10.2021 Etkinlik Tarihi : 07.10.2021 - 09.10.2021
    Ulusal Özet bildiri

20. Comparative calculation of estimated free binding energy between CTX-M-15 and Quercetin, β-lactamases inhibitors by MMGBSA method

    Yazarlar : SARAL AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : 9th International Molecular Biology and Biotechnology Congress, TÜRKİYE, 2020 Basım Tarihi : 15.12.2020 Etkinlik Tarihi : 06.12.2020 - 10.12.2020
    Uluslararası Özet bildiri

21. Drug repositioning to identify SARS-CoV-2 Nsp12/Nsp8 interaction interface inhibitors.

    Yazarlar : MUTLU ÖZAL,UĞUREL OSMAN MUTLUHAN,SARIYER EMRAH,ATA OĞUZ,İnci Tuğba Gül,Uğurel Erennur,KOÇER SİNEM,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : FEMS 2020 ONLINE CONFERENCE, SIRBİSTAN, 2020 Basım Tarihi : 28.10.2020 Etkinlik Tarihi : 28.10.2020 - 31.10.2020
    Uluslararası Özet bildiri

22. Bacteriodes fragillis Enolaz Inhibitorü Belirlenmesine Yönelik Sanal Ligand Tarama ve Moleküler Yanaştırma Çalışmaları

    Yazarlar : Ugurel erennur,KOÇER SİNEM,SARIYER EMRAH,MUTLU ÖZAL,UĞUREL OSMAN MUTLUHAN,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 31. Ulusal Kimya Kongresi, TÜRKİYE, 2019 Basım Tarihi : 20.09.2019 Etkinlik Tarihi : 10.09.2019 - 13.09.2019
    Ulusal Özet bildiri

23. Comparative Modelling and Molecular Dynamic Simulation of Bacteriodes fragillis Enolase

    Yazarlar : Ugurel Erennur, Yakarsonmez Sinem, SARIYER EMRAH, MUTLU ÖZAL, UĞUREL OSMAN MUTLUHAN, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 6th International Bahçeşehir University (BAU) Drug Design Congress, istanbul, TÜRKİYE, 2018 Basım Tarihi : 15.12.2018 Etkinlik Tarihi : 13.12.2018 - 15.12.2018
    Uluslararası Özet bildiri

24. A Structure-Based Drug Design Study Interactions of Bos taurus Enolase and Coumarin Derivatives Through Molecular Docking and Molecular Dynamic Simulation

    Yazarlar : SARIYER EMRAH,yakarsonmez sinem,DANIŞ ÖZKAN,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 6th International Bahçeşehir University (BAU) Drug Design Congress, istanbul, TÜRKİYE, 2018 Basım Tarihi : 14.12.2018 Etkinlik Tarihi : 13.12.2018 - 15.12.2018
    Uluslararası Özet bildiri

25. Bos taurus Kas Enolazını Kodlayan Genin Klonlanması, Ekspresyonu ve Karakterizasyonu

    Yazarlar : SARIYER EMRAH,DANIŞ ÖZKAN,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 19. Uluslararası Katılımlı Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, TÜRKİYE, 2017 Basım Tarihi : 03.12.2017 Etkinlik Tarihi : 01.12.2017 - 03.12.2017
    Uluslararası Özet bildiri

26. Cloning of Peptidyl Prolyl cis/trans Isomerase from Theileria annulata

    Yazarlar : SPAHİ SEZEN,ERDEMİR AYŞEGÜL,YAKARSÖNMEZ SİNEM,SARIYER EMRAH,UĞUREL ERENNUR,AKTAŞ MUNİR,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : IVEK 3rd International Convention ofPharmaceuticals and Pharmacies, İstanbul, TÜRKİYE, 2017 Basım Tarihi : 26.04.2017 Etkinlik Tarihi : 26.04.2017 - 29.04.2017
    Uluslararası Özet bildiri

27. In silico Analyses of both Wild Type and Mutant TaPIN1 towards New Drug Discovery

    Yazarlar : Spahi Sezen,SARIYER EMRAH,MUTLU ÖZAL,Yakarsönmez Sinem,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 5. International BAU Drug Design Congress, İstanbul, TÜRKİYE, 2017 Basım Tarihi : 21.10.2017 Etkinlik Tarihi : 19.10.2017 - 21.10.2017
    Uluslararası Özet bildiri

28. Comprehensive computational analysis of Theileria annulata enolase by comparative modeling and docking

    Yazarlar : MUTLU ÖZAL,SİNEM YAKARSÖNMEZ,SARIYER EMRAH,DANIŞ ÖZKAN,YÜCE DURSUN BAŞAK,TOPUZOĞULLARI MURAT,AKBULUT EKREM,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 17th European Congress on Biotechnology, krakow, POLONYA, 2016 Basım Tarihi : 25.07.2016 Etkinlik Tarihi : 03.07.2016 - 06.07.2016
    Uluslararası Özet bildiri

29. Theileria annulata Enolaz Enziminin Uygun Stabilizatörler Kullanılarak Depolama Koşullarının Belirlenmesi

    Yazarlar : SİNEM YAKARSÖNMEZ,DANIŞ ÖZKAN,MUTLU ÖZAL,YÜCE DURSUN BAŞAK,TOPUZOĞULLARI MURAT,AKBULUT EKREM,SARIYER EMRAH,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : IV. ULUSAL MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE BİYOTEKNOLOJİ KONGRESİ, TÜRKİYE, 2015 Basım Tarihi : 25.08.2015 Etkinlik Tarihi : 21.08.2015 - 24.08.2015
    Ulusal Özet bildiri

30. Fusobacterium nucleatum laktat dehidrogenaz enziminin homoloji modellemesi

    Yazarlar : SARIYER EMRAH,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : XIII. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, AYDIN, TÜRKİYE, 2013 Basım Tarihi : 30.10.2013 Etkinlik Tarihi : 27.10.2013 - 30.10.2013
    Ulusal Özet bildiri

31. Purification and characterization of lactate dehydrogenase enzyme from Fusobacterium nucleatum

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, MILWARD MIKE, COOPER PAUL, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : V International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology, MADRİD, İSPANYA, 2013 Basım Tarihi : 04.10.2013 Etkinlik Tarihi : 01.10.2013 -
    Uluslararası Özet bildiri

32. Fusobacterium nucleatum Laktat Dehidrogenaz Enzimini Kodlayan Genin Klonlanması

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, ERDEMİR ÜSTÜNDAĞ AYŞEGÜL, MILWARD MIKE, COOPER PAUL, ÖZKAN OKTAY EBRU, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 2. Ulusal Moleküler Biyoloji ve Biyoteknoloji Kongresi, ANTALYA, TÜRKİYE, 2012 Basım Tarihi : 18.11.2012 Etkinlik Tarihi : 15.11.2012 -
    Ulusal Özet bildiri

33. Expression of Lactate Dehydrogenase Gene From Fusobacterium nucleatum

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, ERDEMİR ÜSTÜNDAĞ AYŞEGÜL, MILWARD MIKE, COOPER PAUL, ÖZKAN OKTAY EBRU, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : 38 th Federatıon of European Biochemical Societies Congress, Saint Petersburg, RUSYA FEDERASYONU, 2013 Basım Tarihi : 27.11.2013 Etkinlik Tarihi : 06.07.2013 -
    Uluslararası Özet bildiri

Lessons

Administrative Duties

1. Enstitü Müdür Yardımcısı
   ARTVİN ÇORUH ÜNİVERSİTESİ
   2024 - 2025

Articles

1. Molecular Phylogeny of Medicinal-Aromatic Plant Osmanthus decorus from Artvin, Türkiye

   Yazarlar : AKYILDIRIM BEĞEN HAYAL,EMİNAĞAOĞLU ÖZGÜR,ŞEKER PERİNÇEK SEÇKİNOZAN,SELÇUK AHMET YESARİ,YAKIN BATUHAN YAMAN,TEKİNER AYDIN NASİBE,SARAL SARIYER AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : Kastamonu Üniversitesi Orman Fakültesi Dergisi, 2025
   Uluslararası Hakemli ESCI

2. Vanillic acid's potential to enhance AdeIJK, AdeFGH, and AdeABC efflux pump substrates in Acinetobacter baumannii

   Yazarlar : SARAL SARIYER AYŞEGÜL,SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : BIOLOGIA, 2025
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

3. Mutations in the proximal binding site and F-loop of AdeJ confer resistance to efflux pump inhibitors

   Yazarlar : SARAL SARIYER AYŞEGÜL,LEUS INGA,TAMBAT RUSHIKESH,FARJANA MITHILA,OLVERA MARCELA,RUKMANI SHALINI J.,SARIYER EMRAH,SMITH JEREMY C.,WALKER JOHN K,ZGURSKAYA HELEN, Yayın Yeri : ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY, 2025
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

4. Comparative Molecular Docking Analysis of Carbapenem Antibiotics with Ndm-1 and OXA-23 Β-Lactamases: Insights into Binding Mechanisms

   Yazarlar : SARIYER EMRAH,AĞIRBAŞ GAMZE, Yayın Yeri : Clinical and Experimental Health Sciences, 2025
   Uluslararası Hakemli TR DİZİN

5. AdeIJK Pump-Specific Inhibitors Effective against Multidrug Resistant Acinetobacter baumannii

   Yazarlar : TAMBAT RUSHIKESH,KUMAR KINTHADA RAMA,SARAL SARIYER AYŞEGÜL,LEUS, INGA V,SARIYER EMRAH,D’CUNHA NAPOLEON,ZHOU HINMAN,LEASK MAKAILA,WALKER JOHN K,ZGURSKAYA HELEN I, Yayın Yeri : ACS Infectious Diseases, 2024
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

6. Evaluation of the potency of FDA-approved drugs on wild type and mutant SARS-CoV-2 helicase (Nsp13)

   Yazarlar : UĞUREL OSMAN MUTLUHAN,MUTLU ÖZAL,SARIYER EMRAH,KOÇER SİNEM,UĞUREL ERENNUR,INCI TUĞBA GÜL,ATA OĞUZ,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : International Journal of Biological Macromolecules, 2020
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

7. Computational prediction of analog compounds of the membrane protein MCHR1 antagonists ALB-127158 and KRX-104130

   Yazarlar : SARIYER EMRAH, SARAL SARIYER AYŞEGÜL, Yayın Yeri : Springer Science and Business Media LLC, 2023
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

8. Targeting SARS-CoV-2 Nsp12/Nsp8 interaction interface with approved and investigational drugs: an in silico structure-based approach

   Yazarlar : MUTLU ÖZAL,UĞUREL OSMAN MUTLUHAN,SARIYER EMRAH,ATA OĞUZ,İNCI TUĞBA GÜL,UĞUREL ERENNUR,KOÇER SİNEM,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2020
   Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

9. In vitro and in silico evaluation of some plant extracts and phytocompounds against multidrug-resistant Gram-negative bacteria

   Yazarlar : AYDEMIR EDA, SARIYER EMRAH, AKYILDIZ ESMA, ÖZAD DÜZGÜN AZER, CAMADAN YASEMİN, SARAL SARIYER AYŞEGÜL, Yayın Yeri : Springer Science and Business Media LLC, 2022
   Uluslararası Hakemli ESCI

10. Heterologous expression, biochemical characterisation and computational analysis of Bacteroides fragilis enolase

    Yazarlar : UGUREL ERENNUR, KOÇER SİNEM, SARIYER EMRAH, MUTLU ÖZAL, İNCI TUĞBA GÜL, UĞUREL OSMAN MUTLUHAN, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Computational Biology and Chemistry, 2022
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

11. Free Energy Decomposition of CarO Outer Membrane Protein of Acinetobacter baumannii

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : Cumhuriyet Science Journal, 2022
    Ulusal Hakemli TR DİZİN

12. The role of Acinetobacter baumannii CarO outer membrane protein in carbapenems influx

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, Yayın Yeri : RESEARCH IN MICROBIOLOGY, 2022
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

13. A study of Bos taurus muscle specific enolase; biochemical characterization, homology modelling and investigation of molecular interaction using molecular docking and dynamics simulations

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, YAKARSONMEZ SINEM, DANIŞ ÖZKAN, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : International Journal of Biological Macromolecules, 2018
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

14. Comprehensive structural analysis of the open and closed conformations of Theileria annulata enolase by molecular modelling and docking

    Yazarlar : YAKARSÖNMEZ SİNEM,MUTLU ÖZAL,SARIYER EMRAH,DANIŞ ÖZKAN,YÜCE DURSUN BAŞAK,TOPUZOĞULLARI MURAT,AKBULUT EKREM,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Computational Biology and Chemistry, 2016
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

15. Cloning, expression and characterization of the gene encoding the enolase from Fusobacterium nucleatum

    Yazarlar : YAKARSÖNMEZ SİNEM,ÇAYIR EBRU,MUTLU ÖZAL,NURAL BELMA,SARIYER EMRAH,TOPUZOĞULLARI MURAT,MILWARD MIKE,COOPER PAUL,ERDEMİR AYŞEGÜL,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Applied Biochemistry and Microbiology, 2016
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

16. Discovery and evaluation of inhibitory activity and mechanism of arylcoumarin derivatives on Theileria annulata enolase by in vitro and molecular docking studies

    Yazarlar : KOÇER SİNEM,DANIŞ ÖZKAN,MUTLU ÖZAL,TOPUZOĞULLARI MURAT,SARIYER EMRAH,YÜCE DURSUN BAŞAK,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Molecular Diversity, 2020
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

17. Hit identification against peptidyl-prolyl isomerase of Theileria annulata by combined virtual high-throughput screening and molecular dynamics simulation approach

    Yazarlar : SPAHI SEZEN,MUTLU ÖZAL,SARIYER EMRAH,KOÇER SİNEM,UGUREL ERENNUR,BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Computational Biology and Chemistry, 2020
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

18. In vitro inhibition studies of coumarin derivatives on Bos taurus enolase and elucidating their interaction by molecular docking, molecular dynamics simulations and MMGB(PB)SA binding energy calculation

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, KOÇER SİNEM, DANIŞ ÖZKAN, BALIK DİLEK, Yayın Yeri : Bioorganic Chemistry, 2021
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

19. Evaluation of quercetin as a potential ß -lactamase CTX-M-15 inhibitor via the molecular docking, dynamics simulations, and MMGBSA

    Yazarlar : SARIYER EMRAH, SARAL SARIYER AYŞEGÜL, Yayın Yeri : TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY, 2021
    Uluslararası Hakemli SCI-Expanded

Education

1. YILDIZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOMÜHENDİSLİK (DR), 2014 - 2018
2. YILDIZ TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOMÜHENDİSLİK (YL) (TEZLİ), 2011 - 2014
3. İSTANBUL TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK BÖLÜMÜ, 2003 - 2009

Projects

1. Klinik kökenli Escherichia coli izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin taranması ve bazı fitobileşiklerin bu izolatlara karşı in vitro etkinliklerinin analizi
   ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Yürütücü
   Devam Ediyor
2. E.Coli'de Nusg-Kow-Rho Etkileşimini Bloke Edebilecek Doğal Bileşiklerin Hesaplamalı Biyokimyasal Yöntemlerle Tahmini
   ULUSAL -Tübitak 1002 Araştırmacı
   Devam Ediyor
3. Erken Başlangıçlı Preeklampside DPP3’ün RAAS bileşenleri ve KEAP1/NRF2 yolu ile ilişkisi: Klinik bir çalışma
   ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
   Devam Ediyor
4. Salmonella Typhimurium Enfeksiyonlarını Baskılamak için İlaç Hedefi Olan 1-deoksi-D-ksilüloz 5-fosfat redüktoizomeraz'ın Rekombinant Üretimi, Biyokimyasal ve In silico Analizleri
   ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
   Devam Ediyor
5. Çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii'de efluks pompası AdeFGH’ye spesifik inhibitörler ortaya çıkarmak için hesaplamalı ve deneysel yaklaşımlar
   ULUSAL Diğer kamu kuruluşları (Yükseköğretim Kurumları hariç) Araştırmacı
   Tamamlandı , 01.09.2020 - 31.08.2021
6. AdeIJK efluks pompasını overekspres eden mutantların elde edilmesi ve mutant suşlarda bazı antibiyotiklerin MİK değeri üzerine vanillik asit ve resveratrolün etkisinin belirlenmesi
   ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
   Tamamlandı , 08.08.2022 - 08.02.2024
7. Vanillik Asit ve Resveratrol’ün hesaplamalı olarak atomik kuvvet alanlarının tanımlanması ve çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii efflux pompaları hedefli in vitro ve in siliko metodlar ile antimikrobiyal potansiyellerinin belirlenmesi
   ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Yürütücü
   Tamamlandı , 08.08.2022 - 08.02.2024
8. Tıbbi ve Aromatik Bitkilerde DNA barkodlu Etiket Oluşturma
   ULUSAL Diğer kamu kuruluşları (Yükseköğretim Kurumları hariç) Araştırmacı
   Devam Ediyor
9. Neisseria Gonorrhoeae DXR'sini Hedefleyen Yeni İnhibitörler [TÜBİTAK Uluslararası Çoklu İşbirliği Projesi (Mahidol University Thailand)]
   ULUSLARARASI Uluslararası İkili İşbirliği Programları Araştırmacı
   Tamamlandı , 01.11.2021 - 01.02.2025
10. Helicobacter pylori enfeksiyonu için ilaç hedefi olarak FabI'nın rekombinant olarak eldesi ve analizi
    ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
    Tamamlandı , 22.04.2021 - 03.10.2022
11. Bacteroides fragilis Enolazının In vitro ve in silico Analizleri
    ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
    Tamamlandı , 18.05.2018 - 08.04.2020
12. Theileriosis in tedavisinde kullanılabilecek yeni bir ilaç adayı tespit etmek için kumarin türevlerinin Theileria annulata nın enolaz enzimini inhibisyon potansiyelinin araştırılması
    ULUSAL Diğer kamu kuruluşları (Yükseköğretim Kurumları hariç) Araştırmacı
    Tamamlandı , 01.10.2014 - 01.10.2016
13. Bos taurus Enolaz enzimininYapıya Dayandırılmış İlaç Tasarımı Yönünde Yapısal Moleküler ve Enzimatik Analizlerinin Yapılması
    ULUSAL Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi Araştırmacı
    Tamamlandı , 01.09.2015 - 26.09.2017

Certifications

1. TÜBİTAK kongre katılım bursu, Uluslararası
   Burs İTALYA/ROMA 01.09.2024 - 05.09.2024
2. 2219-Yurt Dışı Doktora Sonrası Araştırma Burs Programı, Ulusal
   Araştırma Oklahoma Üniversitesi 15.03.2021 - 10.03.2022
3. Dijital Çağda Yükseköğretimde Öğrenme ve Öğretme, Ulusal
   Sertifika Gümüşhane 07.10.2019 - 01.12.2019
4. Yıldızlı projeler yarışması, Ulusal
   Değerlendirme İstanbul 23.05.2016 - 23.05.2016
5. 7. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
   Çalıştay İstanbul 24.05.2017 - 24.05.2017
6. 6. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
   Çalıştay İstanbul 25.05.2016 - 25.05.2016
7. 5. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
   Çalıştay İstanbul 26.05.2015 - 26.05.2015
8. 4. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
   Çalıştay İstanbul 29.05.2014 - 29.05.2014
9. 3. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
   Çalıştay İstanbul 15.05.2013 - 16.05.2013
10. 2. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
    Çalıştay İstanbul 24.05.2012 - 24.05.2012
11. XIII.Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi katılım bursu, Ulusal
    Burs Aydın/Türkiye 27.10.2013 - 30.10.2013
12. TÜBİTAK kongre katılım bursu, Uluslararası
    Burs Stockholm/İSVEÇ 13.08.2022 - 17.08.2022
13. 1. Yıldız Biyomühendislik Günleri, Ulusal
    Çalıştay İStanbul 16.05.2011 - 17.05.2011
14. TÜBİTAK 2219 Yurtdışı Doktora Sonrası Araştırma Bursu, Uluslararası
    Burs Oklahoma/ABD 15.03.2021 - 15.03.2022

Thesis Consultancy

1. Klinik kökenli Escherichia coli izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin taranması ve bazı fitobileşiklerin bu izolatlara karşı in vitro etkinliklerinin analizi

   ARTVİN ÇORUH ÜNİVERSİTESİ, LİSANSÜSTÜ EĞİTİM ENSTİTÜSÜ, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, 2026
   Yurt İçi Türkiye Devam Ediyor